Флоты
Если в порту имеются ваши флоты, все они перечислены на панели флотов посередине экрана. Между несколькими флотами можно переключаться, щёлкая по вкладкам с портретами капитанов. В окне флота по умолчанию открывается базовая информация о капитане и перечень кораблей флота. Здесь указаны уровень и ежегодное жалование капитана. (Все расходы на выплату жалований, как матросам, так и капитанам автоматически снимаются с вашего счёта в начале каждого года.) Щёлкните по кнопке «Поменять капитана», чтобы поменять местами капитанов этого и любого другого флота. Обратите внимание на то, что для этого действия в порту должен стоять ещё хотя бы один флот. Щёлкните по кнопке «Нанять капитана», чтобы уволить текущего капитана и найти более подходящего. Щелчок по этой кнопке откроет окно капитанов. В нижней части окна указаны умения капитана, если они есть. Рядом со значком умения находится его краткое описание. Пассивные умения действуют постоянно и активируются автоматически. Активные умения — это умения, которые можно активировать во время морского сражения на тактическом уровне. Их время действия ограничено. Щелкните по портрету капитана, и в правой части окна появится подробное описание его умений.
Корабль
Чтобы выбрать корабль, щёлкните левой кнопкой мыши по его значку. По умолчанию откроется окно информации о корабле. Здесь можно отдать приказы о ремонте или найме экипажа или докупить пушечные ядра. Рядом со значком приказа обозначена стоимость соответствующего действия. На борту некоторых кораблей можно размещать морских пехотинцев. Пехотинцы незаменимы во время нападения на порт и при абордаже вражеского судна. Кроме того, при сближении кораблей пехотинцы из ружей ведут огонь по матросам неприятеля. Однако следует иметь в виду, что каждый пехотинец занимает одну тонну грузового трюма. Шлюпы, шхуны и тендеры не могут брать на борт пехотинцев. Рекрутировать морских пехотинцев можно только в домашнем порту или в порту, в котором имеется ваш гарнизон по меньшей мере 2 уровня. Чтобы завербовать пехотинца, щёлкните по плюсику. Чтобы уволить, нажмите «-». Удерживая нажатой клавишу Ctrl, можно завербовать или уволить сразу десять человек. Удерживая нажатой клавишу Shift, можно нанять или уволить сразу все возможное число пехотинцев. Имейте в виду, что для найма необходимо иметь свободное место в грузовом трюме. Вы всегда можете продать свой корабль вместе с грузом и командой.
Пакгауз
Пакгауз — это склад, где хранятся товары. Благодаря этому зданию вы можете приобретать товары по более дешёвой цене и выдерживать их в пакгаузе до тех пор, пока цены на них не пойдут вверх. Действия в окне пакгауза почти аналогичны действиям в окне груза корабля. Из пакгауза можно перемещать товары в факторию и на корабли и обратно. Товары, находящиеся в пакгаузе домашнего порта, можно предлагать другой компании во время переговоров.
Торговля
Всего в игре существуют три вида товаров: важнейшие колониальные товары (ВКТ), товары экспорта и общие товары. О важнейших колониальных товарах вы можете получить наиболее подробную информацию. Выберите колониальный товар, нажав на его значок в левом столбце, и появится график динамики цен на выбранный товар. Под графиком указаны порты, в которых этот товар можно купить. Если вы хотите добиться процветания своей Ост-Индской компании, учитывать динамику цен на колониальные товары просто необходимо. На цену местных ВКТ в порту влияют два фактора: доступный объём товаров и уровень фактории. Чем меньше ВКТ, тем дороже цена. Усовершенствованная фактория даёт существенные скидки компании, которой этот порт принадлежит. Кроме того, фактории более высокого уровня производят ВКТ с большей скоростью. Это следует учитывать при анализе портов, производящих одинаковые ВКТ. Чем выше уровень фактории в порту, тем больше он производит ВКТ. Это особенно важно на поздних стадиях кампании. Экспортные товары — это товары, которые вы перевозите из домашнего порта в другие порты. Как правило, торговать ими не очень выгодно, что соответствует историческим реалиям. Товары общего назначения не так дороги, как ВКТ, но и они могут принести некоторую прибыль.
Морские сражения
Все морские сражения происходят на тактическом уровне. Во время кампании игра переходит на тактический уровень, когда на стратегической карте ваш флот сталкивается с вражеским флотом. Сценарии и все многопользовательские игры происходят только на тактическом уровне. На тактическом уровне вы в любое время можете приостановить игру и открыть панель управления, нажав клавишу Esc. Обратите внимание на то, что сохраняться во время сражения нельзя. Сражение на тактическом уровне происходит в двух режимах: в режиме стратегии реального времени (RTS) и в режиме прямого командования (ПК).
Режим RTS
В режиме RTS управление кораблями осуществляется в реальном времени: вы управляете кораблями, отдавая приказы со стороны, как в классической стратегии реального времени. В верхней части экрана показано соотношение сил в виде шкал, соответствующих двум флотам. Флаги указывают национальную принадлежность компании. Центральная круглая кнопка открывает экран настроек. Две кнопки по сторонам от центральной позволяют выбрать режим сражения: RTS (слева) и ПК (справа). В левой нижней части экрана показаны капитан корабля и мини-карта. Рядом с портретом капитана указаны его умения. Активные умения имеют шкалы восстановления, воспользоваться ими можно только в режиме непосредственного управления. Светлым сектором на мини-карте обозначен угол обзора камеры. Зелёные точки обозначают ваши корабли, а красные — корабли врага. Небольшой кружок с цифрой на ободе компаса показывает направление ветра и его скорость. С правой стороны экрана находится панель кораблей. Чтобы открыть окно корабля, достаточно щёлкнуть по кораблю левой кнопкой мыши. В окне ваших кораблей также имеется кнопка грузового трюма, нажав на которую вы сможете просмотреть груз выбранного корабля. Сбросив груз за борт, вы немного увеличите скорость корабля, но товар будет безвозвратно потерян. В нижней части экрана находится панель управления кораблями вашего флота. Первым слева всегда показан флагман. Под значком каждого корабля указан его статус. Справа от значка корабля находятся три шкалы, меняющие цвет с зелёного до красного. Они обозначают состояние корпуса, парусов и экипажа. Под этими шкалами повреждений указана скорость корабля в узлах. Шкалы по сторонам от корабля обозначают время, необходимое для перезарядки пушек.
Режим прямого командования
В режиме прямого командования вы управляете отдельным кораблём. Чтобы перейти в этот режим, выделите корабль и щёлкните по кнопке прямого командования в верхней панели управления. Можно также перейти к непосредственному управлению флагманом, щёлкнув по портрету капитана флота в левой части экрана. В режиме ПК можно переключаться с одного корабля на другой, щёлкая по значкам кораблей на нижней панели управления или нажимая клавиши F1-F5. В режиме ПК камера зафиксирована на управляемом корабле. В этом режиме вы можете только вращать камеру и изменять масштаб. На некоторые базовые положения камеры можно быстро переключаться, нажав клавишу Tab. В верхнем правом углу экрана расположена камера сражения, показывающая четыре основные вида с палубы корабля.Переключив камеру сражения на вид с борта, вы сможете более эффективно целиться в корабль противника. Сменить точку обзора камеры сражения можно с помощью стрелок в окне камеры сражения. Вы также можете сменить обзор, нажимая клавишу Backspace. Управляя флагманом, вы можете использовать специальные умения капитана. Для этого нажмите соответствующий значок умения или клавишу быстрого выбора (1-9). Рядом со значком каждого активного умения имеется шкала. Она показывает, как долго продлится действие умения или как быстро оно восстановится. Повторно использовать умение можно только после того, как шкала будет полностью заполнена. В режиме непосредственного управления угол обзора на мини-карте не отображается. Выбранный корабль на мини-карте обозначается стрелкой, которая указывает направление, в котором корабль движется. По сторонам от этой стрелки показаны секторы обстрела — это зоны, в которые может попасть выбранный тип снарядов вашего корабля. Под мини-картой расположен ряд кнопок. С левой стороны сверху вниз можно выбрать три типа кучности обстрела: плотную, среднюю и низкую. С правой стороны сверху вниз расположены три кнопки положения парусов: «убрать паруса», «рифить паруса«/«паруса к бою» и «поднять все паруса».
Результаты сражения
После сражения появится окно с результатами, в котором будет показан статус каждого корабля, принявшего участие в сражении. Если вы проходите кампанию и проиграли сражение, то после выхода на стратегический уровень сбежавшие корабли снова перейдут под ваше управление. Если вы выиграли, то сдавшиеся корабли после сражения вернутся в ваш флот, а, кроме того, сдавшиеся вам корабли можно будет ограбить. При этом можно не только загрузить свои корабли чужими товарами, но и добавить вражеские корабли к своему флоту — конечно же, при наличии свободного места и достаточной команды на борту.
Экран добычи
В левой части экрана добычи показаны ваш капитан и ваши корабли, а в правой части — вражеские корабли и их груз. Можно щёлкнуть мышью по отдельному кораблю, чтобы посмотреть его состояние. Перетащив мышью вражеский корабль справа налево, вы добавите его к своему флоту. Если у вас недостаточно членов экипажа для управления всеми вашими кораблями, то игра сообщит вам об этом. Оставленные корабли будут потоплены. Примечание: во флоте не может быть более пяти кораблей.  Груз можно перенести, открыв вкладку «Товары» с правой стороны и открыв грузовой трюм одного из ваших кораблей (щёлкнув по кораблю и открыв вкладку грузового трюма). Затем просто перетаскивайте товары с правой стороны в ваш трюм, как это делается при торговле. Оставленный груз будет утерян.